La fondazione è stata ienaugurata il 18 ottobre 1997 a Riehen vicino a Basilea.  Il nuovo museo è stato costruito in 3 parti da Renzo Piano, architetto genovese di fama internazionale, che ha progettato “le Centre Pompidou” di Parigi. Un ampliamento del museo è stato inaugurato nel 2000.  L’intero museo è stato finanziato dalla Fondazione, creata nel 1982 dai Signori Beyeler.